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martes, 25 de febrero de 2014

Base de Datos Pubmed (Caurta clase de SyT Jueves 20 de Febrero)

Base de Datos PubMed

En la clase de sistemas y tecnología del día 20 de Febrero, el Dr. Juan Carlos Munevar nos habló de la base de datos PubMed y las diferentes herramientas de ésta.
PubMed es un motor de búsqueda de libre acceso a la base de datos de Medline de citaciones y resúmenes de artículos de investigación biomédica. Ofrecido por la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos. Medline tiene alrededor de 4.800 revistas publicadas en Estados Unidos y en más de 70 países de todo el mundo de 1966 hasta la actualidad. [1]

Para acceder a la base de datos anteriormente mencionada podemos hacer clic en el siguiente link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed


Como lo habíamos visto en clases anteriores existen bases de datos de literatura biomédica como Cochrane, la cual es especifica para revisiones sistemáticas y meta-análisis.

... Pero en quien en realidad nos centraremos será en PubMed, pues es una base de datos científica en la cual encontraremos bastante literatura, y tendremos diferentes opciones de búsqueda, gracias a los diferentes tipos de artículos, y filtros que nos ayudan a perfeccionar nuestra búsqueda, para encontrar la información que necesitamos de manera rápida y efectiva.
A continuación, con la ayuda de MeSH Database[2] se definirán cada uno de los tipos de artículos con los que cuenta la base de datos PudMed:


1. Direcciones: Consisten en obras generalmente oficiales, como discursos o declaraciones por escrito, dirigidas a un determinado grupo de personas. Estas son diferentes de conferencias que normalmente se entregan a las clases para fines de instrucción.

2. Autobiografía: Obras consistentes en reportes de auto descripción.

3. Bibliografía: Lista de libros, artículos, documentos, publicaciones, y otros artículos, por lo general de un solo tema o temas relacionados.

4. Biografía: Relato de los hechos, obras y logros, personales y profesionales, durante la vida de una persona. Incluye artículos sobre las actividades y los logros de las personas que viven, así como la presentación de un obituario.

5. Informe de Casos: Manifestaciones clínicas que pueden ser seguidas por estudios de evaluación que eventualmente conducen a un diagnóstico.

6. Artículo Clásico: Presentación actual de un artículo publicado previamente, marcando un hito en la historia de la medicina o la ciencia. Por lo general se acompaña de observaciones preliminares que anuncian su reimpresión, a menudo, en el aniversario de su publicación original o en un aniversario del nacimiento del autor o la muerte. Por lo general, se reproduce en su totalidad, con la referencia bibliográfica completa a la apariencia original.

7. Conferencia Clínica: Conferencia de médicos en sus observaciones de un paciente en la cabecera, en relación con el estado físico, laboratorio y otros hallazgos diagnósticos, manifestaciones clínicas, los resultados de la terapia actual, etc. Una conferencia clínica por lo general termina con una confirmación o corrección de hallazgos clínicos por un diagnóstico patológico realizado por un patólogo. "Conferencia Clínica" se refiere a menudo como una "conferencia clínico-patológica".

8. Ensayo Clínico: Informe de un estudio clínico pre-planificado de la seguridad, eficacia, o la dosis óptima programación de uno o más fármacos de diagnóstico, terapéuticos o profilácticos, dispositivos o técnicas en humanos seleccionados de acuerdo a criterios predeterminados de elegibilidad y observadas para evidencia predefinida de efectos favorables y desfavorables. Aunque la mayoría de los ensayos clínicos se refieren a seres humanos, este tipo de publicación se puede utilizar para artículos veterinarios clínicos que cumplan los requisitos para los seres humanos. Encabezamientos específicos para los tipos y fases específicas de los ensayos clínicos también están disponibles.

9. Ensayo Clínico, fase I: Informe de un estudio clínico controlado generalmente pre-planificado, de la seguridad y eficacia de los medicamentos, diagnósticos terapéuticos o profilácticos, dispositivos o técnicas basadas en un pequeño número de personas sanas y realizados durante el período de un años, ya sea en Estados Unidos o en un país extranjero.

10. Ensayo Clínico, fase II: Estudio clínico controlado generalmente pre-planificado,, de la seguridad y eficacia de los medicamentos de diagnóstico, terapéuticos o profilácticos, dispositivos o técnicas basadas en varios cientos de voluntarios, entre ellos un número limitado de pacientes, y llevó a cabo durante un período de unos dos años, ya sea en Estados Unidos o en un país extranjero.

11. Ensayo Clínico, fase III: Informe de un estudio clínico controlado generalmente pre-planificado,, de la seguridad y eficacia de los medicamentos de diagnóstico, terapéuticos o profilácticos, dispositivos o técnicas posteriores ensayos de fase II. Un grupo suficientemente grande de pacientes es estudiado y vigilado de cerca por los médicos para la respuesta adversa a la exposición a largo plazo, en un período de unos tres años, ya sea en Estados Unidos o en un país extranjero.

12. Ensayo Clínico, fase IV: Informe de un estudio post-comercialización planificada de fármacos de diagnóstico, terapéuticos o profilácticos, dispositivos o técnicas que han sido aprobados para la venta en general después de los ensayos clínicos, fases I, II, y III. Estos estudios, llevados a cabo en los Estados Unidos o un país extranjero, a menudo cosechan datos adicionales sobre la seguridad y eficacia de un producto.

13. Comentario: Nota crítica o explicativa escrita para discutir, apoyar o negar un artículo u otra presentación publicada previamente. Puede adoptar la forma de un artículo, carta, editorial, etc. Aparece en publicaciones bajo una variedad de nombres: comentario, comentario, comentario editorial, punto de vista, etc.

14: Estudio Comparativo: Comparación de los resultados, respuestas, entre otros, para diversas técnicas, enfoques terapéuticos u otros insumos.

15. Congresos: Registros publicados de los trabajos presentados o emitidos con ocasión de congresos individuales, simposios y reuniones; resúmenes de los documentos entregados a tales congresos, informes de los oficiales y delegados de esos congresos, combinaciones de los anteriores, o actos de una conferencia de una sociedad si no se limitan a cuestiones de organización interna.

16. Conferencia de Consenso: Resúmenes de declaraciones en representación de la mayoría y el acuerdo actual de médicos, científicos y otros profesionales de una reunión para llegar a un consenso sobre un tema seleccionado.

17. Conferencia de Consenso, NIH: Resúmenes de declaraciones, de una conferencia patrocinada por el NIH, que representa la mayoría de la opinión actual de los médicos, científicos y otros profesionales sobre un tema seleccionado.

18. Ensayo Clínico Controlado: Ensayo clínico con uno o más tratamientos de prueba, por lo menos un tratamiento de control, medidas de resultado especificadas para evaluar la intervención estudiada, y un método libre de prejuicios para la asignación de los pacientes al tratamiento en estudio. El tratamiento puede ser medicamentos, dispositivos o procedimientos estudiados para la eficacia de diagnóstico, terapéutico, o profiláctico. Las medidas de control incluyen placebos, la medicina activa, sin tratamiento, las formas de dosificación y regímenes, las comparaciones históricas, etc. Se emplean técnicas matemáticas, como tablas de números aleatorios, para asignar a los pacientes para probar o tratamientos de control, la ensayo se caracteriza por ser un ensayo controlado aleatorio.

19. Artículo Corregido y Publicado: Reedición de un artículo para corregir, ampliar o restaurar el texto y los datos del artículo publicado originalmente.

20. Conjunto de DatosUna colección organizada de valores almacenados de forma permanente en una manera formalizada adecuada para la comunicación, interpretación o procesamiento.

21. Diccionario: Un libro de referencia que contiene una lista de palabras - por lo general en orden alfabético - dar información sobre la forma, pronunciación, etimología, gramática y significado. Un diccionario de las lenguas extranjeras es una lista alfabética de palabras de un idioma con su significado y equivalentes en otro idioma.

22. Directorio: Una lista alfabética o clasificada de nombres, organizaciones, temas, etc., dando generalmente títulos, direcciones, afiliaciones, y otros datos profesionales.

23. Publicación Duplicada: Artículo o un libro de material idéntico o casi idéntico publican simultáneamente o sucesivamente a material publicado previamente en otro lugar, sin el reconocimiento de la publicación anterior.

24. Editorial: Una declaración de las opiniones, creencias y política del editor o editor de una revista, por lo general en cuestiones actuales de importancia médica o científica a la comunidad médica o la sociedad en general. Los editoriales publicados por los editores de las revistas que representan el órgano oficial de una sociedad u organización son generalmente sustantiva.

25. Materiales Electrónicos Suplementarios: Contenido o información de apoyo como la animación, los conjuntos de datos, archivos multimedia, video, películas, archivos de audio, archivos de texto, o software, que se presenta para su publicación en un diario en línea o una edición en línea de una revista. Esta información puede ser referenciado en el texto del artículo con un enlace a los datos complementarios previstos.

26. Resumen en Inglés: Año de introducción: 1969

27. Estudios de Evaluación: Estudios que determinen la efectividad o utilidad de los procesos, el personal y los equipos.

28. Festschrift: Colección de ensayos u otros escritos aportados por los estudiantes, profesores, colegas y asociados para honrar a una persona o institución, por lo general con motivo de una celebración de aniversario u otro evento de importancia.

29. Publicaciones Gubernamentales: Documentos expedidos por los gobiernos locales, regionales o nacionales, o por sus agencias o subdivisiones.

30. Pauta: Conjunto de declaraciones, instrucciones, o principios que presentan reglas o política en curso o futuras. Las pautas pueden ser desarrollados por las agencias del gobierno a cualquier nivel, las instituciones, las organizaciones, tales como las sociedades profesionales o consejos de administración, o por la convocatoria de grupos de expertos. El texto puede ser cursiva o en forma de esquema, pero en general es una guía completa de los problemas y enfoques en cualquier disciplina o actividad. Este concepto se refiere a la dirección general y la administración de las actividades de cuidado de salud en lugar de a las decisiones específicas para cada situación clínica particular. Por ese aspecto, las guías de práctica están disponibles.

31. Artículo Histórico: Un artículo o parte de un artículo que da cuenta de los sucesos o circunstancias pasadas significativo en un campo de estudio, una profesión, un descubrimiento, invención, etc. El concepto de la historia es muy amplia, desde los albores del tiempo hasta la actualidad . Este tipo de publicación a menudo se verifica en conjunto con la biografía.

32. In Vitro: Estudios que utilizan tejidos extirpados.

33. Tutorial Interactivo: Grabaciones de video u otros archivos en los que el progreso de la instrucción o el contenido está determinado por la respuesta del usuario.

34. Entrevista: Conversación con un individuo con respecto a su fondo y otros detalles personales y profesionales, las opiniones sobre los temas específicos planteados por el entrevistador, etc.

35. Artículo de Revista Introductorio: Resúmenes  preliminares de un número especial o sección de una revista dedicada a un tema específico. Este texto introductorio puede ser de diversa duración y contenido.

36. Artículo de Revista: El tipo de publicación predominante de artículos y otros elementos indizados para bases de datos de la NLM.

37. Conferencias: Discursos leídos o entregados antes de una audiencia o de clase, especialmente para la enseñanza o para exponer algún tema. Se diferencian de las direcciones (otro tipo de artículo) que son menos didácticas. Un discurso es más informativo, entretenido, inspirado, o polémico.

38. Casos Legales: Colecciones de repertorios de jurisprudencia o de los informes publicados de los casos y los documentos o presentaciones relacionadas con esos casos resueltos.

39. Legislación: Texto del proyecto de ley ya promulgada o que pueden estar en la forma de proyectos de ley, leyes, estatutos, ordenanzas, de las regulaciones gubernamentales.

40. Carta: Escrito o impreso de comunicación entre las personas o entre personas y representantes de las personas jurídicas. La correspondencia puede ser personal o profesional. En las publicaciones médicas y científicas de la carta es por lo general de uno o varios autores al editor de la revista o libro de la publicación del artículo que se está comentado o discutido. "Letter" suele ir acompañada de "comments".

41. Meta-Análisis: Estudios que utilizan un método cuantitativo de la combinación de los resultados de estudios independientes (generalmente extraídas de la literatura publicada) y la síntesis de los resúmenes y conclusiones que se pueden usar para evaluar la eficacia terapéutica, planean nuevos estudios, etc. A menudo es una visión general de los ensayos clínicos. Por lo general, se denomina un meta-análisis por el autor o entidad patrocinadora y debe ser diferenciada de la revisión de la literatura.

42. Estudio Multicéntrico: Estudio controlado ejecutado por varias instituciones cooperantes.

43. Noticias: Anuncio o declaración de hechos recientes o actuales de los nuevos datos y asuntos de interés en el campo de la medicina o la ciencia. En algunas publicaciones, como "Nature" o "ciencia", los informes de noticias son sustantivamente los datos escritos y médicos y científicos anuncian de importancia vital o controversial.

44. Artículo Periodístico: Noticia que aparece en un periódico de interés general u otras publicaciones periódicas de información general, que contiene información de interés actual y oportuna en el campo de la medicina o la ciencia. Este tipo de publicación no se debe confundir con el tipo de publicación "news", reservado a los informes de prensa publicados en diversas revistas científicas médicas o de otro tipo, como "Nature".

45. Estudio Observacional: Un estudio clínico en el que los participantes pueden recibir tipos de diagnóstico, terapéuticos o de otro tipo de intervenciones, pero el investigador no asigna a los participantes a las intervenciones específicas (como en un estudio de intervención).

46. Universal: Una sola cita que abarca varios artículos de diversos grados de especificidad o de una única citación que cubre los trabajos presentados en una reunión. Un tema general se refiere a una serie de artículos sobre un mismo tema, un congreso general se refiere a documentos presentados en una formal local, regional, nacional o internacional; una sociedad global se refiere a los trabajos presentados en un informe anual, semi-anual, mensual semanal, u otra reunión de una sociedad, academia, instituto, hospital, etc. El tipo de publicación puede ser utilizado para una sola cita con o sin la indexación adicional o la catalogación de los documentos individuales. Los trabajos individuales, sin embargo no están etiquetados en overall.

47. Folleto de Educación para Pacientes: Folleto o material informativo autónomo utilizan para explicar un procedimiento o una condición o el contenido de un artículo específico en una revista biomédica y escritos en un lenguaje no técnico para el paciente o consumidor.

48. Índice de publicaciones periódicas: Asunto aproximación a los contenidos de un periódico de emitir un informe anual, bienal, quinquenal, decenal, etc., índice. La rúbrica se utiliza para el cuerpo general de los artículos publicados por una revista en el mismo sentido que la bibliografía es útil cuando se publica como un artículo único.

49. Narraciones Personales: Relatos de la experiencia individual en relación con un determinado campo o de la participación en actividades relacionadas.

50. Retratos: Representaciones gráficas, especialmente de la cara de personas reales, por lo general plantean, vivo o muerto. Son imágenes que tienen por objeto la representación de un individuo o grupo de individuos, no imágenes que simplemente incluyan a personas como parte de un evento o escena.

51. Guía de Práctica: Conjunto de direcciones o principios para ayudar al profesional de la salud con las decisiones del cuidado del paciente acerca de los procedimientos clínicos de diagnóstico, terapéuticos o de otra índole apropiadas para circunstancias clínicas específicas. Las guías de práctica pueden ser desarrollados por las agencias del gobierno a cualquier nivel, las instituciones, las organizaciones, tales como las sociedades profesionales o consejos de administración o por la convocatoria de grupos de expertos. Ellos pueden proporcionar una base para la evaluación y la evaluación de la calidad y eficacia de la atención de la salud en términos de medición de la mejora de la salud, la reducción de la variación en los servicios o procedimientos realizados y la reducción de la variación en los resultados de la atención de salud prestados.

52. Ensayo Clínico Pragmático: Ensayos clínicos aleatorios que comparan las intervenciones en el ámbito clínico y que miran a una serie de resultados e impactos de efectividad.

53. Publicación Errada: Reconocimiento de un error, emitido por un editor, editor o autor. Es habitualmente cita la fuente de donde se produjo el error, dando los datos bibliográficos completos para su recuperación. En el caso de libros y monografías, autor, título, pie de imprenta, la paginación y otras referencias útiles se dará, en el caso de artículos de revistas, el autor, el título, paginación y referencia revista se mostrará. Una esquela errata está mencionado en diversos lugares de erratas o Corrección de errores.

54. Estudio Controlado Aleatorio: Ensayo clínico que implica al menos un tratamiento de prueba y un tratamiento de control la inscripción simultánea y seguimiento de los grupos de prueba y de control-tratado y en el que los tratamientos para ser administrados son seleccionados por un proceso aleatorio tales como el uso de una tabla de números aleatorios.

55. Apoyo a la Investigación, Ley de Recuperación y Reinversión: Año de introducción: 2010

56. Apoyo a la Investigación, N.I.H., Extramuros: Una designación para publicaciones de investigación resultantes de la investigación extramural financiado por los Institutos Nacionales de Salud.

57. Apoyo a la Investigación, N. I. H., Intramuros: Una designación para publicaciones de investigación resultantes de la investigación intramural en los Institutos Nacionales de Salud.

58. Apoyo a la Investigación, Fuera del Gobierno de Estados Unidos: Año de introducción: 2005

59. Apoyo a la Investigación, Gobierno de los Estados Unidos, No-P.H.S.: Año de introducción: 2005

60. Apoyo a la Investigación, Gobierno de los Estados Unidos , P.H.S.: Año de introducción: 2005

61. Apoyo a la Investigación, Gobierno de Estados Unidos: Para las publicaciones señalado como el apoyo de Gobierno de los EE.UU.

62. Publicación Retractada: Designación de un artículo o libro como retraído en su totalidad o en parte por uno o varios autores o un representante autorizado. Identifica una cita previamente publicado y ahora replegada a través de una expedición oficial del autor, editor, u otro agente autorizado, y se distingue de "retracted publication" el cual identifica la citación del elemento original publicado.

63. Retractacióm de Publicación: Declaración emitida por uno o más autores de un artículo o de un libro, se retirará o repudiar el reconocimiento de su participación en la realización de investigaciones o la escritura de los resultados de su estudio. En la indexación, la retracción se envía al editor de la publicación en la que apareció el artículo y se publicó bajo el título "retracción" o en forma de una carta. Este tipo de publicación designa la declaración del autor de retracción: debe ser diferenciada de las etiquetas de "retracted publication".

64. Revisión: Un artículo o libro publicado después del examen del material publicado sobre un tema. Puede ser integral en varios grados y el rango de tiempo del material analizado puede ser amplio o estrecho, pero las críticas más frecuencia deseados son revisiones de la literatura actual. El material de texto examinado puede ser igual de amplia y puede abarcar, en la medicina específicamente, material clínico, así como informes de investigación experimental o de caso. State-of-the-art opiniones tienden a abordar los asuntos más actuales. Una revisión de la literatura debe ser diferenciada de un "historic article" sobre el mismo tema, pero una revisión de la literatura histórica está también dentro del alcance de este tipo de publicación.

55. Revisión Científica Integrada: Informes de la Oficina de Integridad en la Investigación de Estados Unidos, la identificación de la investigación cuestionable publicado en artículos o libros. La notificación de los datos cuestionables se realiza en la Guía del NIH para Becas y Contratos.

66. Revisiones Sistemáticas: Es una descripción de alto nivel de la investigación primaria sobre una pregunta de investigación que trata de identificar, seleccionar, sintetizar y evaluar todas las pruebas de investigación de alta calidad correspondiente a esa pregunta con el fin de responder a ella.

67. Reporte TécnicoInforme formal dando detalles de la investigación y los resultados de un problema científico médico o de otro. Cuando emitido por una agencia de gobierno o un organismo oficial comparable, sus contenidos pueden ser clasificados, no clasificados, o desclasificado en materia de acreditación de seguridad. Este tipo de publicación también puede cubrir un artículo científico o artículo que registra el estado actual o la posición actual de la investigación y el desarrollo científico. Si es así denominado por el editor o el editor, este tipo de publicación se puede utilizar adecuadamente para artículos de revistas. 

68. Doble Estudio: Presentación de informes utilizando un método de detección de las causas genéticas de rasgos humanos y los factores genéticos en el comportamiento utilizando pares de gemelos.

69. Estudios de Validación: Investigación mediante procesos por los cuales se establecen la fiabilidad y la pertinencia de un procedimiento para un propósito específico.

70. Medios de Comunicación de Audio y Video: Se utiliza con los artículos que incluyen archivos de vídeo o clips, o para los artículos que son totalmente video.

71. Webcasts: El contenido de la transmisión de audio o vídeo en directo o en diferido a través de la conexión o se descargan de Internet.




Además de los artículos anteriormente descritos, PubMed cuenta con filtros para
hacer la búsqueda más específica. Estos filtros son:

*Article types: Tipo de arículo

*Text avalability: Disponibilidad del texto

*PudMed Commons: Lo más común en PudMed

*Publication dates: Fecha de publicación

*Species: Especies

*Languages: Idiomas

*Sex: Género

*Subjects: Asiganturas

*Journal Categories: Categorías de revistas

*Ages: Edades

*Search fields: Campos de búsqueda





    LaLa base de datos PubMed, también cuenta con herramientas diferentes que se pueden configurar, y organizar según la prioridad del usuario.


    Para poder acceder a ésta herramientas, primero se debe estar registrado en una cuenta de la NCBI (National Center for Biotechnology Information).


Después de tener una cuenta, se pueden realizar configuraciones como: resaltar las palabras buscadas en los resultados, guardar artículos de interés, enviarlos al correo electrónico, tener un registro de las diferentes búsquedas y entradas realizadas, compartir información pública en bases de datos, foros virtuales, entre otras.




En resumen, con la base de datos PubMed podemos realizar búsquedas rápidas, de manera eficiente, gracias a las diferentes herramientas que ofrece como filtros y configuraciones que facilitan nuestra búsqueda y se acomodan a las necesidades.





Daniela María Diaz Cardoso III Semestre Odontología
Sistemas y Tecnología

Referencias Bibliográficas

[1] PudMed. Wikipedia. [Internet]. 30 de Noviembre de 2013. [Consulta el 22 de Febrero de 2014]. Disponible en: http://es.wikipedia.org/wiki/PubMed

[2] Definicones. MeSH Database. [Internet]. [Consulta el 22 de Febrero de 2014]. Disponible en: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh

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